Produjo la primera y controvertida película de Todd Haynes, Poison, que obtuvo el premio del Gran Jurado en el Festival de cine de Cannes en 1991. Vachon también ha producido el primer film del artista del vídeo Tom Kalin, Swoon, basado en el infame caso de asesinato Leopold / Loeb. Swoon consiguió el codiciado Caligari Award en el Festival de Cine de Berlín de 1992.
Los créditos de Vachon además incluyen la segunda película de Todd Haynes, Safe, protagonizada por Julianne Moore, Postcards from America, de Steve McLean, que se estrenó en el Festival de Cine de Nueva York de 1994. Vachon ejerció de productora ejecutiva en Go Fish, de Rose Troche, y fue coproductora de Kids, de Larry Clarks. A finales de 1994, Vachon produjo Stonewall, de Nigel Finch, que se proyectó en el Festival de Cine de Venecia.
A principios de 1995, produjo Yo disparé a Andy Warhol, dirigida por Mary Harron y protagonizada por Lili Taylor, Jared Harris y Stephen Dorff. Taylor obtuvo un premio especial a la interpretación en el Festival de Cine de Sundance en 1996.
Vachon y Pamela Koffler fundaron Killer Films en 1996. Su asociación surgió a partir de una colaboración que empezó en 1993 en Geoffrey Beene 30, de Tom Kalin, en la que Koffler se encargaba de la línea de producción. Koffler continuó ejerciendo la línea de producción en las tres siguientes películas que produjo Vachon: Kids, en 1994, Stonewall, en 1995 y Yo disparé a Andy Warhol, también en 1995.
La primera producción de Killer fue La Asesina de la Oficina, de Cindy Sherman, protagonizada por Carol Kane, Molly Ringwald y Jeanne Tripplehorn. A continuación Killer produjo Bésame Guido, que se proyectó como parte del programa The American Spectrum en el Festival de Cine de Sundance de 1997.
Killer también produjo Velvet Goldmine, de Todd Haynes, protagonizada por Ewan McGregor, Jonathan Rhys-Myers, Toni Collette y Christian Bale. Happiness, de Todd Solondz también fue estrenada en otoño de 1998. La película en la que aparecen Lara Flynn Boyle, Phillip Seymour Hoffman y Dylan Baker, obtuvo el prestigioso premio Fipresci Critics. En 1999, Koffler y Vachon produjeron Te estoy perdiendo, la adaptación de Bruce Wagner de su novela de éxito de ventas y protagonizada por Rosanna Arquette, Frank Langella y Andrew McCarthy. En 1999, Fox Searchlight estrenó Boys Don’t Cry, de Kimberly Peirce, basada en la historia de Brandon Teena.
Los estrenos más recientes de Killer incluyen, Series 7: The Contenders, que significa el debut cinematográfico del guionista y director Dan Minahan y Crime and Punishment in Suburbia, de Rob Schmidt.
En 1994, Vachon fue premiada con el Frameline Award por su importante aportación en los Medios Gays y Lésbicos y en 1996 se le concedió el prestigioso Muse Award por la New York Women in Film and Televisión. Recientemente, recibió el IFP Gotham Award de 1999 a la producción.
El libro de Vachon, Shooting to Kill: How and Independent Producer Blasts Through the Barriers to Make Movies that Matter, fue publicado en otoño de 1998 por Avon, y fue un éxito de ventas en Los Angeles Times. En otoño del 2001 se publicó su traducción al español.
