Morrissey empezó en el campo de la producción en 1990 con films de bajo presupuesto como la comedia satírica 9 Ninjas y Medio, el thriller Deep Down, protagonizado por George Segal, y Sensation, película producida por HBO con Eric Roberts de protagonista. Pasó entonces a producir The Tie That Binds, con Keith Carrdine y Daryl Hannah. Fue productor ejecutivo de Dr. Jekyll & Mr. Hyde, con Sean Young y Tim Daly, y entonces se incorporó a Rasyter Productions, donde trabajó junto al afamado productor Lawrence Truman, con quien formó The Truman-Morrissey Company.
Produjo American History X, un intenso drama sobre racismo y redención en una familia americana. Esta película le valió a Edward Norton una nominación al Oscar al Mejor Actor.
John produjo su primera película, la popular comedia Booty Call, con un reparto compuesto por Jaime Foxx y Viviana A. Fox, y continuó con American History X. Larry y John fueron productores ejecutivos del telefilm de Truman-Morrissey, Miracle on the Mountain, protagonizado por Patty Duke y William Devane.
Seguidamente llegó Kingdom Come para Fox-Searchlight Films: producida por Morrissey y Edward J. Bates. La película estuvo protagonizada por Whoopi Goldberg.
Al mismo tiempo, Morrissey fue productor ejecutivo, mientras que su socio Truman produjo, What’s The Worth Tha Can Happen?, una comedia de acción con Martin Lawrance y Danny De Vito para la MGM. Tras el retorno de Truman a la academia, John produjo Al Caer la Noche, película con Billy Bob Thornton, Patricia Arquette y Sela Ward en los papeles principales. John produjo a continuación con Beau Flynn 11:14, protagonizada por Hillary Swank, Rachel Leigh-Cook, Barbara Hershey y Patrick Swayze.
Antes de dedicarse a la producción, Morrissey fue actor y apareció en muchas representaciones del circuito off-Broadway, entre las que se incluyen Streamers y Cloud 9, antes de debutar Broadway con en Kingdoms. Trabajó profusamente en el circuito teatral regional, con trabajos que incluyen 13 producciones de obras de Shakespear, antes de ser escogido para un papel en la serie televisiva Hospital General, encarnado al villano Stavros Cassaine. A continuación se pasó al culebrón rival Guiding Light, en la que trabajó durante dos años. John hizo muchas apariciones como “estrella invitada” en shows nocturnos, para más tarde unirse al reparto de la serie cómica de enredo Eisenhower & Lutz.
